随着生物科技的飞速发展,草业科学领域的数据量呈爆炸性增长,其中包含基因组数据、转录组数据等海量信息。生物信息学作为处理这些数据的强大工具,在草业科学中扮演着日益重要的角色。它不仅有助于深入了解基因表达模式、遗传变异和基因功能,还为改良草品种、提高草地生态系统的效率和可持续性提供了科学依据。为了培养草业科学领域学生的生物信息学技能,激发他们对科研的热情,北京林业大学草业与草原学院的草地保护学科青年教师利用寒假时间义务为10余名本科生和研究生开展了一场为期10天的生物信息学研修活动。
研修活动于2024年1月20日正式启动。在这短短的10天里,师生们共同完成了多个重要的生物信息学主题学习,包括Linux虚拟机和服务器常用命令及实操、R语言数据可视化、基因组组装和注释、线粒体基因组分析、密码子偏好性分析、学术论文阅读和撰写,以及进化树构建和共线性分析等多个领域的深入探讨。由于大多数学生都是首次接触这些内容,主讲老师采取了由浅入深的教学方式,通过讲解和演示相结合,确保学生能够充分理解和掌握。上机操作环节使得每个学生都有机会亲手操作,看到自己的分析结果,大大提高了他们的学习热情和自信心。

在研修期间,主讲老师带领同学们来到北京市农林科学院植物保护研究所进行参观交流。这次参观交流活动对于同学们来说是一次难得的机会,让他们能够更深入地了解植物保护领域的研究和实践。在北京市农林科学院植物保护研究所,同学们有幸见到了食用菌研究室主任刘宇研究员和北京植物病理学会秘书长卢彩鸽老师。两位专家与师生们进行了热烈而深入的交流,分享了他们在植物保护领域的经验和见解。
刘宇研究员首先向同学们介绍了食用菌的研究概况和发展趋势。他强调了食用菌在人类食品和农业生态系统中的重要地位,并分享了他们在食用菌培育、种植和病害防治方面取得的一些成果。他特别提到,作为一名研究人员,需要具备扎实的基本功和不断探索的精神,不怕困难,勇于创新。
卢彩鸽老师则从植物病理学的角度,向同学们介绍了植物病害的成因、传播途径和防治方法。她强调了植物病害防治在保障农业生产和生态环境安全方面的重要作用,并鼓励同学们在这个领域发挥自己的专业知识和技能。



通过这次参观交流活动,同学们不仅对植物保护领域有了更深入的了解,也得到了两位专家的指导和建议。通过这次研修,草学院本科生普遍表示收获颇丰,感悟良多。草业22-1班的鲜于张宸深有感触地说,经过这几天的系统性学习,他对线粒体基因组分析和服务器端有了更为深刻的认知。老师耐心地指导大家,结合论文进行分析式教学,并在课余时间组织同学们进行交流,加深了对专业的了解。
梁希23-7班的袁洁在参观北京农林科学研究院后,深受刘宇老师的话语启发,她更加坚定了自己的前进方向。老师们关于林下经济等的交流也让她开阔了眼界,对学科的发展方向有了更清晰的认识。在后续的课程中,老师对基因组学进行了深入浅出的讲解,并指导了低质量碱基的去除、基因组组装、鉴定等实际操作。同时,老师还介绍了线粒体基因组数据的提取和注释方法,以及密码子偏好性的含义和计算方法。在整个教学过程中,老师耐心地解答同学们的问题,共同寻找解决方法,并认真听取同学们的意见,以选择更合适的授课内容和方式。这次学习让同学们学到了许多实用的知识和技能,对学科发展有了更深刻的理解,对自己的未来学习也有了更明确的规划。
梁希23-8班的刘晋艳表示,通过这次十天的学习,她受益匪浅。不仅掌握了之前觉得困难的生信知识,还对科研有了更多的了解。参观北京农林科学院后,她对自己的未来有了更清晰的规划,对未来的大学生活也更加充满期待。
梁希23-7班的麦熙荣认为,这段时间的学习将对他的大学乃至未来的工作产生很大的帮助。老师不仅教授专业知识,还分享了更多课堂之外的人文精神。课后老师与同学们的交流也让他们收获满满。
草坪23班的郭颖姿感谢老师提供的培训机会,让她不仅学习了生信分析的专业知识,还对前沿科技和就业有了更深入的了解。参观北京农林科学院的经历也让她深受触动,刘宇研究员和卢彩鸽老师的分享让她对未来规划更加明确。
梁希23-7班的汪梓屹表示,老师通过深入浅出的方式讲授了生物信息学分析课程,使他们对生信有了基础的认识,并具备了基本的计算机处理能力。通过这次培训,他相信自己能更好地投入到学习中并学以致用。
在本次培训中,多位优秀研究生积极参与,展现出极高的学习热情和专业素养。草学23班的博士生沈良英深感老师在寒假期间的悉心指导尤为珍贵,他从Linux代码的迷惑到熟练操作产出可视化专业图表的优秀生信学者,喜悦之情溢于言表。
农种233班的研究生冷华娟展现出令人惊叹的学习速度,短时间内掌握了一系列命令和数据处理方法,积累了宝贵且不平凡的知识。她的成果充分证明了勤奋和专注的力量。
农种233班的另一位研究生赵丽君表示,此次研修不仅极大地拓宽了她的学术视野,还深化了她对生信理论的理解。她的实际数据分析和论文写作能力也得到了显著提升,为未来的学术研究奠定了坚实基础。
来自农种223班的研究生杨蕊,虽然是首次接触Linux虚拟机、服务器常用命令、R语言数据可视化、基因组组装和注释等复杂内容,但在老师的精心指导下,通过实际操作,她对基因组数据处理有了更为深入的认识。
面对这个充满机遇与挑战的世界,“青年是学习的时期”,我们鼓励无数青年人保持对知识的渴望,通过不断学习开阔视野、增长才干、锤炼品德。他们应秉持创新思维,既立足于本国国情,又放眼全球,努力成为具备家国情怀、真才实学和全球视野的新时代青年。
文字来源:盖云鹏
图片来源:刘晋艳、袁洁、郭颖姿
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